Προσοχή στα πεπτίδια του SARS
Περισσότερα στοιχεία που δείχνουν μια εργαστηριακή προέλευση για τον SARS-CoV-2
*του Naked Emperor*
Μια μελέτη που δημοσιεύθηκε πρόσφατα στο Taylor & Francis - Communicative & Integrative Biology, θέτει περαιτέρω αμφιβολίες για τη ζωονοσογόνο προέλευση της Covid. Ενώ χρησιμοποίησαν μια νέα μέθοδο για να βρουν τον αρχικό ξενιστή του προγόνου του SARS-CoV-2, οι συγγραφείς διαπίστωσαν ότι ο ιός είχε προσαρμοστεί σε νυχτερίδες, ΑΛΛΑ η ακίδα ήταν προσαρμοσμένη στους ανθρώπους. Επιπλέον, κατέληξαν στο συμπέρασμα ότι ο κορωνοϊός είχε περάσει σε τρωκτικά, ενώ η ακίδα είχε περάσει σε αρουραίους πριν από τον ανασυνδυασμό.
Η θεωρία προέλευσης της ζωονόσησης υποδηλώνει ότι ο SARS-CoV-2 προήλθε από νυχτερίδες οι οποίες στη συνέχεια τον μετέδωσαν στους ανθρώπους μέσω ενός ενδιάμεσου ζώου. Το πρόβλημα με αυτή τη θεωρία είναι ότι η πρωτεΐνη ακίδας είναι τόσο κατάλληλη για τον άνθρωπο, αλλά όχι για τις νυχτερίδες.
Για να είναι επιτυχής, ένας ιός πρέπει όχι μόνο να μολύνει τα κύτταρα ενός ξενιστή αλλά και να υπερβαίνει το ανοσοποιητικό του σύστημα. Τα Τ-κύτταρα ενός ξενιστή παίζουν τεράστιο ρόλο στην αναγνώριση και την εξάλειψη νέων ιών. Αυτό το κάνουν εντοπίζοντας πεπτίδια που υπάρχουν στις πρωτεΐνες του ιού αλλά όχι στις πρωτεΐνες του ξενιστή. Τα πεπτίδια είναι μικρές αλυσίδες αμινοξέων που συνδέονται μεταξύ τους με πεπτιδικούς δεσμούς.
Τις περισσότερες φορές, τα ώριμα Τ-κύτταρα αναγνωρίζουν μόνο πεπτίδια που δεν υπάρχουν στον ίδιο τον ξενιστή. Αυτό το κάνουν μεταφέροντας έναν πληθυσμό πανομοιότυπων μορίων στους υποδοχείς με συγγένεια με ένα συγκεκριμένο πεπτίδιο ή μια μικρή ομάδα πεπτιδίων. Είναι επομένως πλεονεκτικό για τα Τ-κύτταρα να έχουν ένα στενό πεπτιδικό λεξιλόγιο επειδή στη συνέχεια αναγνωρίζει το ευρύτερο φάσμα πεπτιδίων σε έναν ιό. Ο ιός θέλει επίσης ένα μικρό λεξιλόγιο πεπτιδίων γιατί σημαίνει λιγότερους στόχους για αναγνώριση των Τ-κυττάρων.
Ο ιός εξαλείφει επίσης τα περιττά πεπτίδια από τις δικές του πρωτεΐνες, δηλαδή αυτές που δεν βρίσκονται στον ξενιστή. Με την πάροδο του χρόνου, τα πεπτιδικά λεξιλόγια του ξενιστή και του ιού γίνονται όλο και περισσότερο παρόμοια. Ο αριθμός των πεπτιδίων που υπάρχουν στον ιό αλλά όχι στον ξενιστή ονομάζεται ανοσολογική Τ-απόσταση. Όσο μικρότερη είναι αυτή η απόσταση, τόσο καλύτερα προσαρμοσμένος είναι ο ιός στο είδος του ξενιστή. Επομένως, το είδος με τη μικρότερη Τ-απόσταση θα πρέπει να είναι ο φυσικός ξενιστής για έναν συγκεκριμένο ιό.
Έτσι, οι συγγραφείς ανέλυσαν τις Τ-αποστάσεις για τον SARS-CoV-2 και 38 εκπροσώπους όλων των μεγάλων κλάδων θηλαστικών. Ως έλεγχο, έκαναν την ίδια ανάλυση με δέκα άλλα ζώα και ανθρώπινους κορωνοϊούς, συμπεριλαμβανομένου του RaTG13 που υποτίθεται ότι προέρχεται από δείγματα που ελήφθησαν από νυχτερίδες σε κινεζικό ορυχείο και είναι ο πλησιέστερος πρόγονος του SARS-CoV-2. Ωστόσο, πολλοί εικάζουν ότι ο RaTG13 επινοήθηκε απλώς για να καλύψει ίχνη…
Βρήκαν ότι για τον SARS-CoV-2 ΧΩΡΙΣ την πρωτεΐνη ακίδας, το πιο κοντινό ταίριασμα ήταν η μεγάλη πεταλωτή νυχτερίδα. Αυτό συμβαδίζει με τη θεωρία προέλευσης της ζωονόσησης. Ωστόσο, αυτός ήταν ο ιός χωρίς την ακίδα.
Όταν αναλύθηκε μόνο η ακίδα, το πιο κοντινό ταίριασμα ήταν με τον άνθρωπο.
Η παραπάνω ανάλυση έγινε εξετάζοντας πεπτίδια με πέντε αμινοξέα. Όταν κοιτάζετε πεπτίδια με έξι αμινοξέα, η εξέλιξη του λεξιλογίου των πεπτιδίων είναι ταχύτερη, ώστε να μπορείτε να μάθετε περισσότερα για την ιστορία του.
Όταν η ανάλυση έγινε με πεπτίδια με έξι αμινοξέα, αποκάλυψε ότι ο SARS-CoV-2 χωρίς την ακίδα ήταν πιο κοντά σε ένα τρωκτικό. Η ακίδα στον SARS-CoV-2 ήταν πιο κοντά σε μαύρο αρουραίο και στον RaTG13 ένα ποντίκι του σπιτιού. Αυτό υποδηλώνει ότι ο ιός και η ακίδα μεταβιβάστηκαν σε αυτά τα ζώα πριν ανασυνδυαστούν.
Οι συγγραφείς καταλήγουν στο συμπέρασμα ότι “τα αποτελέσματα δεν απαντούν στο ερώτημα εάν ο νέος ιός είναι προϊόν φυσικού ανασυνδυασμού δύο ιών ή το αποτέλεσμα σκόπιμης εισαγωγής του γονιδίου για την πρωτεΐνη ακίδας στο γονιδίωμα άλλων ειδών κορωνοϊού. Φυσικά, η πιθανότητα δύο προγόνων του SARS-CoV-2 – ένας προσαρμοσμένος σε πεταλωτές νυχτερίδες και ένας στον άνθρωπο – να μεταφερθούν για λίγο σε δύο διαφορετικά είδη πειραματόζωων πριν από ένα γεγονός φυσικού ανασυνδυασμού, δεν φαίνεται μεγάλη”.
Συνολικά προτείνουν ότι, ενώ δεν το αποδεικνύει, η ανάλυση υποστηρίζει σθεναρά την τεχνητή προέλευση του SARS-CoV-2.
Όπως είναι αναμενόμενο, υπάρχουν πολλοί επικριτές αυτής του νέας μελέτης. Κάποιοι ισχυρίζονται ότι το άλμα στους αρουραίους συνέβη στο κινεζικό ορυχείο. Άλλοι αμφισβητούν γιατί οι συγγραφείς εστίασαν στα πεπτίδια με πέντε ή έξι αμινοξέα. Ωστόσο, εάν η ανάλυση αποδειχθεί σωστή, είναι περαιτέρω στοιχεία που δείχνουν την εργαστηριακή προέλευση του SARS-CoV-2.