ΜΕΛΕΤΗ: Ταυτοποίηση μιας μεταλλακτικής υπογραφής που σχετίζεται με το molnupiravir
σε βάσεις δεδομένων αλληλούχησης SARS-CoV-2
Περίληψη
Το Molnupiravir, ένα αντιικό φάρμακο που έχει χρησιμοποιηθεί ευρέως κατά του SARS-CoV-2, δρα προκαλώντας μεταλλάξεις στο γονιδίωμα του ιού κατά την αντιγραφή. Οι περισσότερες τυχαίες μεταλλάξεις είναι πιθανό να είναι επιβλαβείς για τον ιό και πολλές θα είναι θανατηφόρες.
Τα αυξημένα ποσοστά μετάλλαξης που προκαλούνται από τη μολνουπιραβίρη έχει αποδειχθεί ότι μειώνουν το ιικό φορτίο σε ζωικά μοντέλα. Ωστόσο, είναι πιθανό ορισμένοι ασθενείς που υποβάλλονται σε θεραπεία με μολνουπιραβίρη να μην εκκαθαρίσουν πλήρως τις λοιμώξεις από τον SARS-CoV-2, με πιθανότητα περαιτέρω μετάδοσης των μεταλλαγμένων από το molnupiravir ιών.
Ξεκινήσαμε να διερευνήσουμε συστηματικά τις παγκόσμιες βάσεις δεδομένων αλληλούχησης για την υπογραφή της μεταλλαξιογένεσης του molnupiravir. Διαπιστώνουμε ότι μια συγκεκριμένη κατηγορία μακριών φυλογενετικών κλάδων εμφανίζεται σχεδόν αποκλειστικά σε αλληλουχίες από το 2022, μετά την εισαγωγή της θεραπείας με molnupiravir και σε χώρες και ηλικιακές ομάδες με ευρεία χρήση του φαρμάκου.
Υπολογίζουμε ένα φάσμα μεταλλάξεων από την ελεγχόμενη με εικονικό φάρμακο κλινική δοκιμή AGILE της μολνουπιραβίρης και δείχνουμε ότι η υπογραφή της, με αυξημένα ποσοστά G-σε-A και C-σε-T, αντιστοιχεί σε μεγάλο βαθμό στο φάσμα μεταλλάξεων που παρατηρείται σε αυτούς τους μεγάλους κλάδους.
Τα δεδομένα μας υποδηλώνουν ότι η υπογραφή της μεταλλαξιογένεσης του molnupiravir μπορεί να παρατηρηθεί σε παγκόσμιες βάσεις δεδομένων αλληλούχησης, σε ορισμένες περιπτώσεις με μετέπειτα μετάδοση.
