*της Joomi*
Ακολουθεί μια ερώτηση στην οποία θα έπρεπε να είχαμε απαντήσει πριν κυκλοφορήσουμε τα εμβόλια mRNA σε δισεκατομμύρια ανθρώπους:
Μπορούν να παρέμβουν στο φυσικό RNA ενός κυττάρου;
Τύποι RNA στο κύτταρο
Τα κύτταρα περιέχουν φυσικά πολλούς διαφορετικούς τύπους RNA. Μερικά έχουν τη μορφή mRNA, ή αγγελιαφόρου RNA, αλλιώς γνωστά ως “μεταγραφές”. Αυτά μεταφράζονται σε πρωτεΐνες, “κωδικοποιούν” τις πρωτεΐνες.
Υπάρχει επίσης "μη κωδικοποιητικό RNA" που αναφέρεται σε RNA που δεν μεταφράζεται σε πρωτεΐνη. Υπάρχουν διαφορετικοί τύποι μη κωδικοποιητικού RNA και δεν καταλαβαίνουμε τι κάνουν όλοι. Μερικοί μπορεί να σας είναι γνωστοί, όπως το RNA μεταφοράς και το ριβοσωμικό RNA, αλλά άλλα ανακαλύφθηκαν πρόσφατα.
Υπάρχει μια συζήτηση σχετικά με το σε ποιο ποσοστό τα μη κωδικοποιητικά RNA είναι λειτουργικά. Μερικοί ερευνητές πιστεύουν ότι όλα έχουν λειτουργίες μέσα στο κύτταρο, ενώ άλλοι πιστεύουν ότι τουλάχιστον μερικά από αυτά δεν εξυπηρετούν καμία λειτουργία.
Μπορούν τα εμβόλια mRNA να παρέμβουν στο RNA του κυττάρου;
Όταν ένα κύτταρο προσλαμβάνει εμβόλιο mRNA, έχει προσλάβει (“διαμολύνεται με”) μονόκλωνο mRNA, που θα μπορούσε ενδεχομένως να αλληλεπιδράσει με άλλα RNA του κυττάρου.
Συγκεκριμένα, το mRNA μπορεί να συζευχθεί με άλλα κομμάτια μονόκλωνου RNA που τυχαίνει να έχουν συμπληρωματικά ζεύγη βάσεων. Αυτό μερικές φορές ονομάζεται “συμπληρωματικότητα αλληλουχίας νουκλεοτιδίων Watson-Crick”.
Η παρακάτω εικόνα δείχνει αυτό με το DNA, αλλά μια παρόμοια διαδικασία μπορεί να συμβεί με το RNA:
Η εικόνα δείχνει πώς δύο μονοί κλώνοι με συμπληρωματικές νουκλεοτιδικές αλληλουχίες μπορούν να σχηματίσουν ζεύγη βάσεων για να σχηματίσουν δίκλωνο DNA. Οι “βάσεις” στο DNA είναι η θυμίνη, η αδενίνη, η κυτοσίνη και η γουανίνη. Βάσεις θυμίνης (Τ) ζευγαρώνουν με αδενίνη (Α) και κυτοσίνης (C) με γουανίνη (G).
Με το RNA, η θυμίνη αντικαθίσταται με ουριδίνη και η βάση της ουριδίνης ζευγαρώνει με αδενίνη. Έτσι, εάν έχετε μια αλληλουχία νουκλεοτιδίων RNA μορφής UAGC, μπορεί να σχηματίσει ζεύγη βάσεων με μονόκλωνο RNA που έχει AUCG. Αυτό θα είχε ως αποτέλεσμα δίκλωνο RNA, το οποίο πυροδοτεί μια διαδικασία στο κύτταρο που ονομάζεται “σίγαση RNA”. Αυτή η διαδικασία αναζητά και αποικοδομεί δίκλωνο RNA. Τα κύτταρά μας πιθανώς το κάνουν αυτό ως άμυνα έναντι ιών που έχουν δίκλωνο RNA.
Τώρα, πώς θα ξέρουμε εάν η εισαγωγή ξένου mRNA, όπως του εμβολίου mRNA, παρεμβαίνει στο φυσικό RNA ενός κυττάρου;
Θα πρέπει να έχουμε μια ιδέα για τις πιθανές αλληλουχίες RNA που υπάρχουν στα κύτταρά μας. Ευτυχώς, υπάρχουν βάσεις δεδομένων με τέτοιου είδους πληροφορίες, οπότε θα μπορούσε κανείς να τις αναζητήσει για αλληλουχίες που είναι συμπληρωματικές με το εμβόλιο mRNA.
Τι έκανε μια μελέτη
Ένας ερευνητής έκανε ακριβώς αυτό: Τα εμβόλια mRNA για την COVID-19 ως υποθετικοί επιγενετικοί παίκτες: Αποτελέσματα από μια ανάλυση in silico, εκτιμήσεις και προοπτικές
Έψαξαν για ανθρώπινες κωδικοποιητικές ή μη αλληλουχίες, που θα μπορούσαν να συνδυαστούν με το εμβόλιο mRNA της Pfizer για την COVID-19 (BNT162b2).
Αυτό το είδος αναζήτησης ονομάζεται συχνά "ευθυγράμμιση". Υπάρχουν διαφορετικοί αλγόριθμοι για την εκτέλεση ευθυγραμμίσεων, όπως ο BLAST (βασικό εργαλείο αναζήτησης τοπικής ευθυγράμμισης) ή ο BLAT (εργαλείο ευθυγράμμισης που μοιάζει με BLAST), το οποίο είναι μια παραλλαγή του BLAST.
Μπορείτε ακόμη και να παίξετε μόνοι σας με αυτό. Η ακολουθία για το εμβόλιο της Pfizer βρίσκεται στο τέλος του εγγράφου εδώ. Θα παρατηρήσετε ότι η αλληλουχία περιέχει τα κανονικά νουκλεοτίδια G, C και A, αλλά αντί για U έχει “Ψ”. Αυτό συμβαίνει επειδή στο εμβόλιο αντικατέστησαν όλες τις ουριδίνες με κάτι που ονομαζόταν “N1-μεθυλψευδουριδίνη”. Για να κάνετε οποιοδήποτε είδος ευθυγράμμισης, πρέπει πρώτα να αντικαταστήσετε όλες τις περιπτώσεις του "Ψ" με το "U".
Στη συνέχεια, αντιγράψτε αυτήν την ακολουθία και επικολλήστε την εδώ στο πλαίσιο που λέει "Enter Query Sequence". Στη συνέχεια, κάντε κλικ στο "BLAST" κοντά στο κάτω μέρος.
Υπάρχουν κάποιες παράμετροι με τις οποίες θα μπορούσε κανείς να παίξει με το BLAST (δείτε εδώ), αλλά έτσι μοιάζει η διαδικασία στην πιο βασική της μορφή.
Παρεμπιπτόντως, το "BLASTN" είναι απλώς ένα είδος προγράμματος BLAST που προορίζεται ειδικά για τη σύγκριση αλληλουχιών νουκλεοτιδίων με άλλες αλληλουχίες νουκλεοτιδίων. Αυτό είναι απλώς για να το διαφοροποιήσουμε από άλλα πράγματα που μπορείτε να κάνετε με το BLAST, όπως η σύγκριση δύο πρωτεϊνών (BLASTP), κλπ.
Τα αποτελέσματα
Τι βρίσκουμε λοιπόν αν κάνουμε αυτό το είδος αναζήτησης με το εμβόλιο της Pfizer;
Το mRNA του BNT162b2 ταίριαξε με 19 ανθρώπινα γονίδια των οποίων τα πρωτεϊνικά προϊόντα εμπλέκονται ποικιλοτρόπως σε αντιδράσεις ενζύμων, δέσμευση νουκλεοτιδίων ή κατιόντων, σηματοδότηση και λειτουργίες φορέα.
Με άλλα λόγια, το mRNA του εμβολίου θα μπορούσε δυνητικά να παρέμβει στην έκφραση 19 ανθρώπινων γονιδίων.
Βρήκαν ότι το mRNA του εμβολίου ευθυγραμμίστηκε επίσης με ορισμένα μη κωδικοποιητικά RNA (ncRNAs):
Η ανάλυση BLASTN έναντι γονιδίων ανθρώπινου ncRNA αποκάλυψε 17 αποτελέσματα στο mRNA BNT162b2, Συμπληρωματικός Πίνακας 2. Συγκεκριμένα, το mRNA του BNT162b2 έδειξε ομολογία αλληλουχίας με 1 μιτοχονδριακό ριβοσωμικό RNA (mt rRNA) και 16 μακρά μη κωδικοποιητικά (lnc) RNA γονίδια
Και πάλι, θυμηθείτε ότι οι λειτουργίες πολλών μη κωδικοποιητικών RNA δεν είναι καλά κατανοητές. 16 από τα αποτελέσματα ήταν σε “μακροχρόνιο μη κωδικοποιητικό RNA”. Αυτά είναι μακρά RNA που δεν μεταφράζονται σε πρωτεΐνη και μπορεί να εμπλέκονται στη γονιδιακή ρύθμιση.
Σε 5 περιπτώσεις, τα αποτελλεσματα έπεσαν σε ρυθμιστικές περιοχές των ανθρώπινων γονιδίων lncRNA (2 προαγωγείς και 3 πλευρές προαγωγέα), των οποίων τα γειτονικά γονίδια κωδικοποίησης πρωτεΐνης αναστέλλουν αναβολικές ή προφλεγμονώδεις οδούς, ελέγχουν τη μιτοχονδριακή αναπνευστική αλυσίδα ή προεδρεύουν στον μεταβολισμό των λιπιδίων.
Μετάφραση: Το "αναβολικό" αναφέρεται σε οποιαδήποτε διαδικασία που δημιουργεί πολύπλοκα μόρια από απλούστερα μόρια. Είναι το αντίθετο μιας “καταβολικής” διαδικασίας που διασπά πολύπλοκα μόρια σε απλούστερα μόρια, όπως όταν διασπάτε τα τρόφιμα. Η “μιτοχονδριακή αναπνευστική αλυσίδα” αποτελείται από πολλά ένζυμα που είναι βασικά για τη λειτουργία των μιτοχονδρίων, τα οποία παράγουν ATP, γνωστό και ως το “ενεργειακό νόμισμα” του κυττάρου. Το κύριο σημείο εδώ είναι ότι το mRNA του εμβολίου θα μπορούσε να μπλέξει με τη ρύθμιση ορισμένων πολύ σημαντικών διεργασιών.
Και:
Επιπλέον, 12 από τα 17 συμπληρωματικά μεταγραφήματα mRNA του BNT162b2 βρέθηκαν να αλληλεπιδρούν με τροποποιήσεις ιστόνης (H3K27me3, H3K4me1 και H3K4me3) που χαρακτηρίζουν τυπικά τα eRNA [21, 43]. Τα eRNA συντίθενται από lncRNAs και κανονικά δεν είναι ούτε ματισμένα, ούτε πολυαδενυλιωμένα [44]. Με τη στρατολόγηση της RNA πολυμεράσης II και άλλων πρωτεϊνών σε θέσεις προαγωγέα, ελέγχουν επιγενετικά τη μεταγραφή των απομακρυσμένων γονιδίων. Αν και υπάρχει σε χαμηλούς αριθμούς αντιγράφων, μια ανεπάρκεια eRNAs μπορεί να επηρεάσει έντονα τη μεταγραφή των γονιδίων που κωδικοποιούν τις πρωτεΐνες, συμπεριλαμβανομένων εκείνων που εμπλέκονται στην κυτταρική διαφοροποίηση. Η έκφρασή τους είναι αυξημένη στους ανθρώπινους καρκινικούς ιστούς [45, 46] και τα eRNA μπορούν να οδηγήσουν τόσο σε γενετικές μεταλλάξεις, όσο και σε επιγενετικές δυσρυθμίσεις, οι οποίες με τη σειρά τους ρυθμίζουν ελαττωματικά την έκφραση ογκογονιδίων ή ογκοκατασταλτικών γονιδίων [46]. Μέχρι σήμερα, είναι άγνωστο εάν η χορήγηση εμβολίων mRNA για την COVID-19 ενέχει πραγματικό κίνδυνο καρκινογένεσης.
Μετάφραση: Οι "ιστόνες" είναι πρωτεΐνες που βοηθούν στην περιέλιξη του DNA σε συμπαγείς δομές. Οι “τροποποιήσεις ιστόνης” μπορούν να επηρεάσουν τον τρόπο με τον οποίο τυλίγονται συγκεκριμένα τμήματα του DNA, τα οποία επηρεάζουν το πόσο προσβάσιμα είναι τα γονίδια σε αυτά τα τμήματα και επομένως επηρεάζουν τον τρόπο έκφρασης αυτών των γονιδίων. Τα “eRNA” είναι ενισχυτικά RNA, τα οποία είναι ένας άλλος τύπος μη κωδικοποιητικού RNA που μπορεί να εμπλέκεται στη ρύθμιση της γονιδιακής έκφρασης.
Η μελέτη αναγνωρίζει επίσης ότι το εμβόλιο δεν πρόκειται να παραμείνει στο σημείο της ένεσης, κοντά στους μύες:
Επιπλέον, η βιοκατανομή του mRNA του εμβολίου στους ανθρώπινους ιστούς, συμπεριλαμβανομένης της ποσότητας που προσλαμβάνεται από τους σκελετικούς μύες, είναι επικίνδυνη δεδομένης της έλλειψης εξειδίκευσης ιστού αυτών των ενώσεων.
Και ενώ μπορεί να έχουμε επίσης διαταραχές στο RNA από τη λοίμωξη του SARS-CoV-2, υπάρχει συνήθως μεγαλύτερη επιλεκτικότητα ιστού υπό ιογενή λοίμωξη, σε σύγκριση με την ένεση του εμβολίου. Οι περισσότερες λοιμώξεις περιορίζονται και δεν οδηγούν σε ιούς στο αίμα που εξαπλώνεται συστημικά.
Αντίθετα, η υψηλότερη επιλεκτικότητα κυττάρων και ιστών του SARS-CoV-2 μπορεί να καταστήσει τις επιπλοκές που σχετίζονται με τη συμπληρωματικότητα της αλληλουχίας προς τα γονίδια ή τα μεταγραφήματα RNA ξενιστή πιο διαισθητικές.
Διαπίστωσαν επίσης ότι υπήρχαν περισσότερες διαταραχές με την αλληλουχία του εμβολίου mRNA σε σύγκριση με την αλληλουχία για την πρωτεΐνη S του SARS-CoV-2:
Συνοπτικά, αυτά τα υπολογιστικά αποτελέσματα υποδεικνύουν ότι το εμβόλιο mRNA για την COVID-19 μπορεί να επηρεάσει βαθύτερα το επιγενετικό τοπίο των κυττάρων-δεκτών σε σύγκριση με τις επιδράσεις του γονιδίου S κατά τη διάρκεια φυσικής μόλυνσης, ιδιαίτερα σε σχέση με μονοπάτια που σχετίζονται με πολλαπλασιασμό ή φλεγμονή, Εικ. 1.
Το “επιγενετικό” αναφέρεται στο πώς τα κύτταρα ελέγχουν την έκφραση των γονιδίων. Έτσι, οι επιγενετικές αλλαγές είναι επιδράσεις που αλλάζουν τον τρόπο έκφρασης των γονιδίων, αλλά στην πραγματικότητα δεν αλλάζουν τα ίδια τα γονίδια.
Το έγγραφο αναφέρει ότι το εμβόλιο mRNA θα μπορούσε “υποθετικά να προκαλέσει επιγενετική ανισορροπία των γονιδίων-στόχων και την τελική ανάπτυξη μακροπρόθεσμων επιπλοκών”:
Αυτή η κεντρική in silico ανάλυση δείχνει ότι τόσο το γονίδιο S του RNA του SARS-CoV-2 όσο και το εμβόλιο mRNA BNT162b2 που κωδικοποιεί την πρωτεΐνη S μοιράζονται τη συμπληρωματικότητα νουκλεοτιδίου Watson-Crick με ανθρώπινα κωδικοποιητικά και μη γονίδια που, ενώ δεν έχουν το ίδιο μοτίβο συμπληρωματικότητας, μπορεί υποθετικά προκαλούν επιγενετική ανισορροπία των γονιδίων-στόχων και την τελική ανάπτυξη μακροχρόνιων επιπλοκών.
Και:
Απαιτείται περαιτέρω έρευνα για την καλύτερη αποσαφήνιση των επιγενετικών επιδράσεων του εμβολίου BNT162b2 και, ευρύτερα, των φαρμάκων που βασίζονται σε mRNA στα κύτταρα λήπτες.
Μπορείτε να το ξαναπείτε αυτό.
Τι είδους συμπτώματα θα βλέπαμε;
Ας υποθέσουμε ότι τα εμβόλια mRNA παρενέβησαν είτε στα κωδικοποιητικά, είτε στα μη κωδικοποιητικά RNA στα κύτταρά μας: τι είδους συμπτώματα θα περιμέναμε να δούμε;
Είναι ασαφές. Θα εξαρτιόταν από το ποια RNA θα διαταράσσονταν και το σε ποια κύτταρα κατέληξε το εμβόλιο.
Αν είναι στα μυϊκά κύτταρα, μπορεί να μην είναι μεγάλη υπόθεση, αλλά αν είναι στα κύτταρα της καρδιάς… Επιφανειακά μπορεί να μοιάζει με φλεγμονή των καρδιακών ιστών – πάρα πολύ σαν μυοπερικαρδίτιδα…
Τα συμπτώματα ενδέχεται να διαφέρουν ευρέως μεταξύ των ατόμων, εν μέρει επειδή η κατανομή του εμβολίου θα ήταν τυχαία. Πιθανότατα θα είχαμε μια μεγάλη ποικιλία συμπτωμάτων που θα φαινόταν εντελώς άσχετα μεταξύ τους.
Κάτω από αυτό το σενάριο, θα είχαμε ελπίδα να εντοπίσουμε σωστά όλα, ή ακόμα και τα περισσότερα, ανεπιθύμητα συμβάντα; Ειδικά με το παθητικό “σύστημα επιτήρησης” ανεπιθύμητων ενεργειών που έχουμε;
Φαίνεται αμφίβολο…