Ποσοστιαία ακεραιότητα του RNA στο πλαίσιο των εμβολίων COVID-19
Γιατί είναι σημαντικό; Σχετίζεται με τη συχνότητα αναφοράς σοβαρών ανεπιθύμητων ενεργειών;
*της Jessica Rose*
Είχα μια συνομιλία με τον αγαπητό μου φίλο Mathew Crawford χθες στο podcast του Rounding the Earth. Μπορείτε να το παρακολουθήσετε εδώ. Ως διορθώσεις λεπτομερειών, η πρωτεΐνη ακίδας έχει 1.273 αμινοξέα για τον SARS-CoV-2. Αυτός είναι πιθανώς ο λόγος που η Moderna αναφέρεται στο προϊόν της ως mRNA-1273.
Το πλήρες μήκος της S του SARS-CoV-2 έχει μήκος 1.273 αμινοξέων με πολλούς λειτουργικούς τομείς και πολλαπλές θέσεις πρωτεολυτικής διάσπασης στο όριο S1/S2 και στη θέση S2'.¹
Επίσης, στο τέλος, όταν κάναμε την άσκηση μοντελοποίησης, είχα διαβάσει λάθος τα δεδομένα του αριθμού των δόσεων ανά παρτίδα εμβολίου. Δεν αλλάζει το συμπέρασμα ότι υπάρχουν διαφορές “τάξης μεγέθους” στις παρτίδες εμβολίου σε σχέση με τον αριθμό των διαθέσιμων δόσεων. Ακολουθούν οι σωστές μέγιστες και ελάχιστες τιμές για τον αριθμό των δόσεων ανά παρτίδα εμβολίου σύμφωνα με το μέγεθος της παρτίδας και τους αριθμούς αποστολής.
Μέγιστος αριθμός δόσεων = 1.539.300 (Υπήρχαν 15.393 αποστολές της παρτίδας FL0007 με 100 δόσεις ανά αποστολή)
Ελάχιστος αριθμός δόσεων = 58.500 (Υπήρχαν 5 αποστολές της παρτίδας EP7533 με 11.700 δόσεις ανά αποστολή)
Στην πραγματικότητα ετοίμασα ένα slide deck για χρήση σε αυτό το podcast ως ένα είδος “μορφής διάλεξης”, αλλά δεν μπορούσα να μοιραστώ την οθόνη, οπότε θα αφήσω τις διαφάνειες εδώ. Το slide deck είναι ένα μάθημα βιοχημείας, πραγματικά πίσω στα βασικά σε συνδυασμό με διαρροές δεδομένων ποσοστιαίας ακεραιότητας RNA και στοιχεία ότι αυτή η γνωστή χαμηλή ποσοστιαία ακεραιότητα RNA προκαλεί ανοσολογικό χάος.
Φαίνεται πως τα “φρέσκα” προϊόντα να κάνουν μεγαλύτερη ζημιά και αυτό μπορεί με τη σειρά του να είναι το αποτέλεσμα της μικρότερης αποικοδόμησης που έχει επακολουθήσει, δηλαδή:
Υψηλότερη ποσοστιαία ακεραιότητα RNA → πιο κοντά στην πρωτεΐνη ακίδας πλήρους μήκους. Δεν είμαι σίγουρη ακόμα.
Αυτήν τη στιγμή εξετάζω τα αναπάντητα ερωτήματά μας σχετικά με την επίδραση της διαστρωμάτωσης από δημογραφικά στοιχεία, για παράδειγμα και άλλα προσεγμένα πράγματα.
Αν έχετε καλές ιδέες, πείτε τις στα σχόλια. Θα τα αφήσω ανοιχτά σε όλους. :)
Μείνετε συντονισμένοι…
1 Zhu, C., He, G., Yin, Q., Zeng, L., Ye, X., Shi, Y., & Xu, W. (2021). Molecular biology of the SARs-CoV-2 spike protein: A review of current knowledge. Journal of medical virology, 93(10), 5729–5741. https://doi.org/10.1002/jmv.27132.